Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPO11Q9Y5K1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPO11Q9Y5K1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPO11Q9Y5K1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms