Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B8

NME7, Nucleoside diphosphate kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME7Q9Y5B8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NME7Q9Y5B8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME7Q9Y5B8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME7Q9Y5B8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms