Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4BQ9Y4P1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG4BQ9Y4P1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG4BQ9Y4P1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG4BQ9Y4P1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms