Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFE2L3Q9Y4A8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFE2L3Q9Y4A8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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