Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZDHHC9Q9Y397 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZDHHC9Q9Y397 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms