Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIK3Q9Y2K2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK3Q9Y2K2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK3Q9Y2K2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms