Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC2Q9Y235 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOBEC2Q9Y235 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC2Q9Y235 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC2Q9Y235 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC2Q9Y235 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
APOBEC2Q9Y235 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOBEC2Q9Y235 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms