Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SHOC2Q9UQ13 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHOC2Q9UQ13 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHOC2Q9UQ13 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms