Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH4Q9UQ05 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH4Q9UQ05 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms