Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PADI4Q9UM07 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PADI4Q9UM07 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PADI4Q9UM07 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms