Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH9Q9ULB4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH9Q9ULB4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH9Q9ULB4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms