Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDC42EP3Q9UKI2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC42EP3Q9UKI2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC42EP3Q9UKI2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC42EP3Q9UKI2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms