Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CROTQ9UKG9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CROTQ9UKG9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CROTQ9UKG9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms