Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DNMT3LQ9UJW3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DNMT3LQ9UJW3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DNMT3LQ9UJW3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms