Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RIMS3Q9UJD0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms