Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VAX2Q9UIW0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VAX2Q9UIW0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAX2Q9UIW0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms