Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAI1Q9UI46 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAI1Q9UI46 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAI1Q9UI46 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms