Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SS18L2Q9UHA2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SS18L2Q9UHA2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SS18L2Q9UHA2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SS18L2Q9UHA2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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