Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM10Q9UDY6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM10Q9UDY6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms