Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APEX2Q9UBZ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APEX2Q9UBZ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms