Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPS7AQ9UBW8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPS7AQ9UBW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPS7AQ9UBW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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