Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRPC4Q9UBN4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms