Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1AQ9UBC5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYO1AQ9UBC5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYO1AQ9UBC5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1AQ9UBC5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms