Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
C6orf48Q9UBA6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
C6orf48Q9UBA6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms