Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCOR3Q9P2K3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCOR3Q9P2K3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms