Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC88CQ9P219 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC88CQ9P219 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC88CQ9P219 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms