Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VSX1Q9NZR4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VSX1Q9NZR4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms