Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EHD3Q9NZN3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EHD3Q9NZN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms