Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPG21Q9NZD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPG21Q9NZD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPG21Q9NZD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms