Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLGN3Q9NZ94 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NLGN3Q9NZ94 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NLGN3Q9NZ94 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms