Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MKS1Q9NXB0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MKS1Q9NXB0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms