Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OXSMQ9NWU1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OXSMQ9NWU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms