Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNHIT6Q9NWK9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNHIT6Q9NWK9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNHIT6Q9NWK9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms