Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EXD2Q9NVH0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EXD2Q9NVH0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms