Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANK4Q9NVE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANK4Q9NVE7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANK4Q9NVE7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms