Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM140Q9NV12 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM140Q9NV12 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms