Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP8A2Q9NTI2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP8A2Q9NTI2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A2Q9NTI2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms