Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS00

C1GALT1, Glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1GALT1Q9NS00 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1GALT1Q9NS00 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1GALT1Q9NS00 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms