Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS45Q9NRW7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS45Q9NRW7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VPS45Q9NRW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms