Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDR39U1Q9NRG7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDR39U1Q9NRG7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SDR39U1Q9NRG7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms