Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CCNB1IP1Q9NPC3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms