Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPHS2Q9NP85 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPHS2Q9NP85 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPHS2Q9NP85 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms