Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EPB41L4AQ9HCS5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EPB41L4AQ9HCS5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EPB41L4AQ9HCS5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms