Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POPDC3Q9HBV1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POPDC3Q9HBV1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POPDC3Q9HBV1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms