Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CLK4Q9HAZ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLK4Q9HAZ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms