Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SMURF2Q9HAU4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMURF2Q9HAU4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMURF2Q9HAU4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms