Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP13A3Q9H7F0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP13A3Q9H7F0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP13A3Q9H7F0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms