Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLMPQ9H6B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLMPQ9H6B4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLMPQ9H6B4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms