Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMOC1Q9H4F8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMOC1Q9H4F8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMOC1Q9H4F8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMOC1Q9H4F8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMOC1Q9H4F8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMOC1Q9H4F8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMOC1Q9H4F8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMOC1Q9H4F8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMOC1Q9H4F8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms