Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SEMA6BQ9H3T3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SEMA6BQ9H3T3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA6BQ9H3T3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEMA6BQ9H3T3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.3 ms